Ekstrakurikuler adalah kegiatan diluar jam Madrasah yang bertujuan mengembangkan kemampuan potensi dan rasa tanggung jawab srerta memberikan kesempatan kepada peserta didik untuk meningkatkan potensi siswa itu dengan secara optimal serta terpadu yang melingkupi bakat, minat, serta kreativitas. Berikut ini Ekstrakulikuler di Pondok Pesantren Nurul Huda.
1. PRAMUKA
Gugus Depan Nurul Huda
Gerakan Pramuka Gugus Depan Nurul Huda adalah kegiatan Kepramukaan Yayasan Pondok Pesantren Nurul Huda terbagi menjadi tiga, yaitu pramuka siaga, penggalang dan penegak. Kegiatan kepramukaan yang dilaksanakan setiap jum’at siang ini juga memiliki kegiatan Persami tahunan yang dilaksanakan setiap tahun nya di bulan agustus. Tujuan Praja Muda Karana Gugus Depan Nurul Huda untuk membentuk karakter yang siap menjadi generasi Dasa Dharma yang mampu menjadi pemimpin berjiwa kholifah ,bertakwa, cinta tanah air, taat kepada hukum, berjiwa patriot dan berakhlak mulia.
Nomer Gudep Mts NH : 06.1951-1952
Nomer Gudep MA NH : 06.1949-1950

2. MARCHING BAND
Nurul Huda Marching Band
One Dream, Blessing.
NH Marching Band adalah salah satu Extrakulikuler yang bertujuan menjadi wadah kreatifitas siswa yang berminat dengan alat musik. NH Marching Band (Orkes Barisan) adalah sekelompok barisan orang yang memaikan satu atau beberapa lagu dengan menggunakan sejumlah kombinasi alat musik (tiup, perkusi dan sejumlah instrument marching bell) secara bersama-sama kombinasi dari permainan music (tiup, perkusi) serta aksi baris-berbaris dari pemainnya yang tentunya dilatih oleh tenaga ahli yang professional dalam bidangnya,
3. PASKIBRA
Tonti Nurul Huda
Tonti Nurul Huda (Pleton Inti Nurul Huda ) adalah pasukan Baris Berbaris yang anggotanya adalah siswa Mts dan MA adalah pasukan inti pengibar bendara yang bertugas mengibarkan Bendara Merah Putih di Acara HUT Pondok Pesantren Nurul Huda. Tujuan Tonti NH adalah menumbuhkan sikap disiplin, mandiri, bertanggung jawab, dan berbudi pekerti luhur dalam rangka pembentukan character building generasi muda Indonesia.
4. PENCAK SILAT
Persaudaraan Setia Hati Terate
Persaudaraan Setia Hati Terate (PSHT) atau yang dikenal dengan SH Terate adalah suatu persaudaraan “perguruan” silat yang bertujuan mendidik dan membentuk manusia berbudi luhur, tahu benar dan salah, bertakwa kepada Tuhan Yang Maha Esa, mengajarkan kesetiaan pada hati sanubari sendiri serta mengutamakan persaudaraan. makna setia hati adalah diri setia kepada hati sanubari yang senantiasa menghadap dan berkiblat kepada tuhan yang maha esa. Kombinasi antara ajaran spiritual (ilmu kebatinan) dengan gerakan pencak silat adalah yang digunakan sebagai dasar dari ilmu pencak silat Setia Hati terate. Dalam latihan PSHT seorang siswa akan diajarkan berbagai keterampilan pencak silat yang mudah diterima dan dipahami. Siswa juga diajarkan untuk menjadi manusia yang berbudi luhur tahu benar dan salah dalam kehidupan.
5. SENI HADRAH
Hadrah adalah suatu kesenian dalam bentuk seni tari dan/atau nyanyian yang bernafaskan Islam disertai dengan alunan rebana. Biasanya, hadrah digunakan untuk menyemarakan acara-acara yang sedang berlangsung, kesenian dengan menggunakan alat-alat musik tepuk yang memiliki hiasan kerincing logam di sekitar bingkainya, dibuat dari papan kayu yang dilobangi ditengahnya, dan pada salah satu sisinya dipasang kulit kambing tipis yang telah disamak yang dikenal dengan nama rebana atau terbangan di Jawa. Pondok Pesantren Nurul Huda juga menyiapkan Seni hadrah sebagai wadah kreatifitas siswa.
6. KELAS SEPAK BOLA
Sepak Bola merupakan cabang olahraga yang sangat populer di masyarakat. Di Indonesia olahraga jenis ini sudah sangat merakyat. Demikian halnya bagi siswa Madrasah Nurul Huda. Dengan melihat keadaan ini maka kegiatan Extrakurikuler dibentuk dan dikembangkan dengan harapan mampu mengembangkan talenta dengan harapan dapat berperan aktif dalam kehidupan bermasyarakat maupun untuk lebih berprestasi di masa yang akan datang.
7. SENI REOG PONOROGO
Reog Ponorogo adalah seni pertunjukan khas Ponorogo yang mengabungkan musik, tari, bela diri dan olah vokal. Ekstrakurikuler reog bertujuan untuk menumbuhkan kecintaan terhadap budaya lokal dan cinta tanah air.